Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc102aQ3TMW1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc102aQ3TMW1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms