Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c3Q3TMP1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c3Q3TMP1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms