Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul4aQ3TCH7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms