Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3KNL4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3KNL4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3KNL4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3KNL4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3KNL4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3KNL4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms