Protein–RNA interactions for Protein: Q3B807

Tcerg1l, Transcription elongation regulator 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1lQ3B807 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcerg1lQ3B807 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcerg1lQ3B807 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcerg1lQ3B807 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms