Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmprss11cQ1JRP2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Tmprss11cQ1JRP2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmprss11cQ1JRP2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms