Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Perm1Q149B8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Perm1Q149B8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Perm1Q149B8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Perm1Q149B8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Perm1Q149B8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Perm1Q149B8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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Perm1Q149B8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Perm1Q149B8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Perm1Q149B8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Perm1Q149B8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms