Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrioQ0KL02 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrioQ0KL02 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrioQ0KL02 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms