Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn2bQ0KL01 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn2bQ0KL01 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn2bQ0KL01 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms