Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kndc1Q0KK55 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kndc1Q0KK55 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Kndc1Q0KK55 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kndc1Q0KK55 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms