Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnnm1Q0GA42 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnnm1Q0GA42 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cnnm1Q0GA42 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnnm1Q0GA42 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms