Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col9a2Q07643 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col9a2Q07643 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col9a2Q07643 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms