Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fmn1Q05860 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fmn1Q05860 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Fmn1Q05860 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Fmn1Q05860 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fmn1Q05860 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms