Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox9Q04887 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox9Q04887 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox9Q04887 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms