Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk16Q04735 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk16Q04735 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk16Q04735 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk16Q04735 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk16Q04735 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk16Q04735 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms