Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RelaQ04207 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RelaQ04207 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelaQ04207 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RelaQ04207 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RelaQ04207 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RelaQ04207 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms