Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnd1Q03719 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnd1Q03719 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnd1Q03719 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms