Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnb1Q03717 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnb1Q03717 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnb1Q03717 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms