Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Runx1Q03347 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Runx1Q03347 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms