Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacna1sQ02789 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cacna1sQ02789 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna1sQ02789 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms