Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nhlh1Q02576 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nhlh1Q02576 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlh1Q02576 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlh1Q02576 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlh1Q02576 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlh1Q02576 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlh1Q02576 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nhlh1Q02576 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nhlh1Q02576 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nhlh1Q02576 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms