Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RykQ01887 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RykQ01887 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RykQ01887 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RykQ01887 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RykQ01887 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RykQ01887 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RykQ01887 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RykQ01887 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RykQ01887 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RykQ01887 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RykQ01887 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RykQ01887 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RykQ01887 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RykQ01887 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RykQ01887 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RykQ01887 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RykQ01887 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RykQ01887 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RykQ01887 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RykQ01887 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RykQ01887 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RykQ01887 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RykQ01887 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RykQ01887 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RykQ01887 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RykQ01887 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RykQ01887 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RykQ01887 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RykQ01887 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RykQ01887 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RykQ01887 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RykQ01887 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RykQ01887 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RykQ01887 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RykQ01887 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RykQ01887 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RykQ01887 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RykQ01887 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RykQ01887 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RykQ01887 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RykQ01887 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RykQ01887 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RykQ01887 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RykQ01887 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RykQ01887 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RykQ01887 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RykQ01887 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RykQ01887 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RykQ01887 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RykQ01887 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RykQ01887 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RykQ01887 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RykQ01887 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RykQ01887 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RykQ01887 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RykQ01887 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RykQ01887 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RykQ01887 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RykQ01887 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RykQ01887 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RykQ01887 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RykQ01887 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RykQ01887 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RykQ01887 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RykQ01887 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RykQ01887 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RykQ01887 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RykQ01887 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RykQ01887 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RykQ01887 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RykQ01887 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RykQ01887 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RykQ01887 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RykQ01887 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RykQ01887 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RykQ01887 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RykQ01887 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RykQ01887 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RykQ01887 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RykQ01887 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms