Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabpaQ00422 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GabpaQ00422 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabpaQ00422 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms