Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cds1P98191 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cds1P98191 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cds1P98191 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cds1P98191 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cds1P98191 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cds1P98191 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cds1P98191 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms