Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad4P97471 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smad4P97471 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad4P97471 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad4P97471 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad4P97471 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad4P97471 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad4P97471 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smad4P97471 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smad4P97471 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smad4P97471 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smad4P97471 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Smad4P97471 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smad4P97471 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smad4P97471 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smad4P97471 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smad4P97471 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Smad4P97471 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smad4P97471 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad4P97471 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smad4P97471 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smad4P97471 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smad4P97471 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad4P97471 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad4P97471 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smad4P97471 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smad4P97471 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad4P97471 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smad4P97471 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smad4P97471 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smad4P97471 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad4P97471 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smad4P97471 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad4P97471 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smad4P97471 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smad4P97471 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smad4P97471 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smad4P97471 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smad4P97471 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad4P97471 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad4P97471 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms