Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf1P84078 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf1P84078 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arf1P84078 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf1P84078 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arf1P84078 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arf1P84078 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms