Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf3P70671 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf3P70671 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf3P70671 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf3P70671 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irf3P70671 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf3P70671 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf3P70671 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf3P70671 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf3P70671 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf3P70671 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf3P70671 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf3P70671 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf3P70671 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf3P70671 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms