Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sparcl1P70663 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sparcl1P70663 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sparcl1P70663 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms