Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SeboxP70368 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeboxP70368 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeboxP70368 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms