Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprvP70289 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprvP70289 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprvP70289 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprvP70289 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprvP70289 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprvP70289 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprvP70289 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprvP70289 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprvP70289 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprvP70289 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprvP70289 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprvP70289 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprvP70289 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprvP70289 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprvP70289 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprvP70289 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprvP70289 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprvP70289 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprvP70289 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprvP70289 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprvP70289 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprvP70289 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprvP70289 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprvP70289 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms