Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Surf6P70279 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Surf6P70279 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Surf6P70279 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Surf6P70279 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Surf6P70279 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf6P70279 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf6P70279 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms