Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pkn1P70268 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkn1P70268 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkn1P70268 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms