Protein–RNA interactions for Protein: P70174

Hrh1, Histamine H1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh1P70174 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hrh1P70174 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hrh1P70174 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hrh1P70174 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms