Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psme3P61290 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psme3P61290 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme3P61290 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psme3P61290 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme3P61290 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms