Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PlnP61014 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PlnP61014 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PlnP61014 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PlnP61014 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PlnP61014 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PlnP61014 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PlnP61014 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PlnP61014 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PlnP61014 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PlnP61014 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PlnP61014 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PlnP61014 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PlnP61014 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PlnP61014 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PlnP61014 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PlnP61014 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PlnP61014 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PlnP61014 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PlnP61014 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PlnP61014 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PlnP61014 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PlnP61014 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PlnP61014 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PlnP61014 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PlnP61014 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PlnP61014 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PlnP61014 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PlnP61014 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PlnP61014 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PlnP61014 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PlnP61014 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PlnP61014 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms