Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp1P60335 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcbp1P60335 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms