Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3b6P59708 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b6P59708 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms