Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Csrnp1P59054 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Csrnp1P59054 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csrnp1P59054 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms