Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GferP56213 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GferP56213 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GferP56213 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GferP56213 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GferP56213 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GferP56213 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GferP56213 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GferP56213 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GferP56213 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GferP56213 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GferP56213 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GferP56213 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GferP56213 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GferP56213 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GferP56213 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GferP56213 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GferP56213 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GferP56213 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GferP56213 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GferP56213 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GferP56213 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GferP56213 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GferP56213 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GferP56213 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GferP56213 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GferP56213 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GferP56213 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GferP56213 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GferP56213 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GferP56213 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GferP56213 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GferP56213 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GferP56213 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GferP56213 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GferP56213 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GferP56213 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GferP56213 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GferP56213 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GferP56213 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GferP56213 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GferP56213 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GferP56213 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GferP56213 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GferP56213 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GferP56213 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GferP56213 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GferP56213 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GferP56213 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GferP56213 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GferP56213 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GferP56213 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GferP56213 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GferP56213 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms