Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp1P55194 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1P55194 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms