Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn5P54830 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn5P54830 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms