Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad23bP54728 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rad23bP54728 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad23bP54728 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.8 ms