Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PctpP53808 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PctpP53808 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PctpP53808 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PctpP53808 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PctpP53808 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PctpP53808 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PctpP53808 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PctpP53808 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PctpP53808 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PctpP53808 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PctpP53808 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PctpP53808 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PctpP53808 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PctpP53808 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PctpP53808 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PctpP53808 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PctpP53808 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PctpP53808 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PctpP53808 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PctpP53808 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PctpP53808 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PctpP53808 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PctpP53808 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PctpP53808 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PctpP53808 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PctpP53808 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PctpP53808 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PctpP53808 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PctpP53808 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PctpP53808 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PctpP53808 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PctpP53808 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PctpP53808 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PctpP53808 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PctpP53808 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PctpP53808 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PctpP53808 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PctpP53808 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PctpP53808 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PctpP53808 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PctpP53808 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PctpP53808 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PctpP53808 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PctpP53808 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PctpP53808 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PctpP53808 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PctpP53808 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PctpP53808 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PctpP53808 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms