Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SqleP52019 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SqleP52019 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SqleP52019 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqleP52019 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqleP52019 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqleP52019 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqleP52019 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqleP52019 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqleP52019 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqleP52019 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqleP52019 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqleP52019 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqleP52019 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SqleP52019 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SqleP52019 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SqleP52019 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SqleP52019 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SqleP52019 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SqleP52019 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SqleP52019 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SqleP52019 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SqleP52019 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SqleP52019 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SqleP52019 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SqleP52019 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SqleP52019 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SqleP52019 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqleP52019 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqleP52019 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqleP52019 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqleP52019 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqleP52019 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqleP52019 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqleP52019 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqleP52019 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SqleP52019 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SqleP52019 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SqleP52019 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SqleP52019 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SqleP52019 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SqleP52019 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SqleP52019 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SqleP52019 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SqleP52019 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SqleP52019 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqleP52019 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqleP52019 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqleP52019 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqleP52019 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqleP52019 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqleP52019 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqleP52019 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqleP52019 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqleP52019 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqleP52019 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SqleP52019 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqleP52019 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqleP52019 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqleP52019 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqleP52019 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SqleP52019 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SqleP52019 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SqleP52019 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SqleP52019 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SqleP52019 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SqleP52019 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SqleP52019 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SqleP52019 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SqleP52019 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SqleP52019 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SqleP52019 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SqleP52019 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SqleP52019 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SqleP52019 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SqleP52019 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SqleP52019 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SqleP52019 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SqleP52019 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SqleP52019 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SqleP52019 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SqleP52019 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms