Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ApodP51910 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ApodP51910 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ApodP51910 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ApodP51910 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ApodP51910 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ApodP51910 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ApodP51910 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ApodP51910 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ApodP51910 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ApodP51910 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ApodP51910 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ApodP51910 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ApodP51910 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ApodP51910 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ApodP51910 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ApodP51910 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ApodP51910 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ApodP51910 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ApodP51910 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ApodP51910 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ApodP51910 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ApodP51910 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ApodP51910 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ApodP51910 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ApodP51910 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ApodP51910 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ApodP51910 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ApodP51910 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ApodP51910 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ApodP51910 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ApodP51910 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ApodP51910 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ApodP51910 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ApodP51910 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ApodP51910 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ApodP51910 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ApodP51910 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ApodP51910 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ApodP51910 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ApodP51910 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ApodP51910 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ApodP51910 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ApodP51910 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ApodP51910 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ApodP51910 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ApodP51910 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ApodP51910 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ApodP51910 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ApodP51910 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ApodP51910 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ApodP51910 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ApodP51910 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ApodP51910 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ApodP51910 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ApodP51910 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ApodP51910 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ApodP51910 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ApodP51910 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ApodP51910 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ApodP51910 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ApodP51910 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ApodP51910 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ApodP51910 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ApodP51910 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ApodP51910 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ApodP51910 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ApodP51910 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ApodP51910 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ApodP51910 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ApodP51910 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ApodP51910 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ApodP51910 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ApodP51910 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ApodP51910 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ApodP51910 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ApodP51910 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ApodP51910 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ApodP51910 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ApodP51910 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ApodP51910 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ApodP51910 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ApodP51910 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ApodP51910 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ApodP51910 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ApodP51910 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ApodP51910 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ApodP51910 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ApodP51910 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms