Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn3P51791 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn3P51791 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcn3P51791 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms