Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr5P51682 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr5P51682 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms