Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa-rs12P50716 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa-rs12P50716 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa-rs12P50716 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa-rs12P50716 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms