Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FanccP50652 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FanccP50652 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FanccP50652 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FanccP50652 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FanccP50652 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FanccP50652 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FanccP50652 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FanccP50652 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FanccP50652 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FanccP50652 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FanccP50652 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FanccP50652 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FanccP50652 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FanccP50652 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FanccP50652 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FanccP50652 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FanccP50652 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FanccP50652 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FanccP50652 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FanccP50652 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FanccP50652 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FanccP50652 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FanccP50652 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FanccP50652 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FanccP50652 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FanccP50652 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FanccP50652 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FanccP50652 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FanccP50652 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FanccP50652 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FanccP50652 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FanccP50652 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FanccP50652 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FanccP50652 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FanccP50652 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FanccP50652 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FanccP50652 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FanccP50652 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FanccP50652 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FanccP50652 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FanccP50652 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FanccP50652 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FanccP50652 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FanccP50652 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FanccP50652 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FanccP50652 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FanccP50652 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FanccP50652 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FanccP50652 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FanccP50652 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FanccP50652 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FanccP50652 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FanccP50652 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FanccP50652 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FanccP50652 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FanccP50652 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FanccP50652 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FanccP50652 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms