Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbp3P49194 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbp3P49194 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbp3P49194 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms